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植物物种鉴定

植物物种鉴定

通过DNA barcoding 技术分析RBCLMATK基因,可对植物进行物种水平的鉴定。特定的法医应用中,则需辅助特异遗传标记,进一步地进行分析。该技术适用单一种属来源样本的分析。

价格¥650

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北京科鉴基因中心

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等级: [专业机构]

评价: 4.9分

中心公告:结果客观真实反应。可提供上门采集样本服务,接收国内外邮寄样本(仅限个人鉴定)。同时提供STR分型检测技术培训和解决方案。

温馨提示: 周六日提前一天预约,安排值班接待办理。

中心地址:北京市海淀区

办理时间:周一到周日:9:00-17:00(周六日提前一天预约)

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项目用途:  确认单一植物物种

项目规格:  DNA barcoding 技术分析RBCL&MATK基因

检测周期:  5-7个工作日。

办理方式:  邮寄样本,上门取样。

样本类型:  叶片、种子、DNA

样本要求:  未高温处理过

      通过DNA barcoding 技术分析RBCL&MATK基因,可对植物进行物种水平的鉴定。特定的法医应用中,则需辅助特异遗传标记,进一步地进行分析。该技术适用单一种属来源样本的分析,若样本为多物种混合来源,则采用我公司的CELL STR ID技术进行分析。

NCBI数据库物种比对确认步骤
使用NCBI数据库确认物种通常涉及序列比对和物种鉴定。以下是详细步骤指南:
 
一、使用BLAST进行序列比对确认物种
访问NCBI BLAST
打开NCBI网站 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)
点击"BLAST"工具或直接访问 https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/
选择适当的BLAST程序
核苷酸序列: 选择"nucleotide BLAST" (blastn)
蛋白质序列: 选择"protein BLAST" (blastp)
对于未知类型的序列,可选择"blastx"或"tblastn"
输入查询序列
在查询框中粘贴FASTA格式的序列
或上传包含序列的文件
设置数据库和参数
数据库选择:
核苷酸: "nr/nt" (非冗余核苷酸数据库)
蛋白质: "nr" (非冗余蛋白质数据库)
限制物种范围(可选): 在"Organism"框中输入已知或怀疑的物种名称
其他参数通常可使用默认值
运行BLAST
点击"BLAST"按钮提交任务
分析结果
查看"Descriptions"选项卡中的匹配结果
重点关注:
E-value (越小越好,通常<0.001)
Query cover (覆盖度,越高越好)
Percent identity (相似度,越高越好)
检查匹配物种的学名和共同信息
 
二、使用NCBI Taxonomy确认物种分类
访问NCBI Taxonomy数据库
直接访问 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy
搜索物种
在搜索框中输入物种名称(学名或俗名)
或输入Taxonomy ID (如果已知)
查看分类信息
确认完整的分类等级(界、门、纲、目、科、属、种)
检查同义词和常见名称
查看相关序列和出版物
 
三、使用其他NCBI工具确认物种
NCBI Nucleotide/Protein数据库
搜索已知的物种特异性标记基因(如16S rRNA、COI等)
比较查询序列与已知物种标记的相似性
NCBI Genome数据库
对于全基因组或大片段,可比较与参考基因组的相似性
访问 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/
 
四、多序列比对确认(更精确的方法)
下载多个相关物种的同源序列
使用Clustal Omega、MAFFT等工具进行多序列比对
构建系统发育树(MEGA、PhyML等工具)
通过进化关系确认物种分类地位
 
注意事项
对于微生物,16S rRNA基因比对是常用方法,但可能分辨率有限
对于高等生物,可考虑使用多个标记基因联合分析
相似度阈值参考:
16S rRNA: >97%通常视为同一物种
COI基因: >98%通常视为同一物种
结合形态学、生态学等其他证据进行综合判断
通过以上步骤,您可以在NCBI数据库中有效地比对序列并确认物种分类信息。
平台信息

北京司法鉴定平台

北京司法鉴定平台是是遵照中华人民共和国司法部颁布的鉴定机构管理办法,经北京司法局核准登记的专业司法鉴定机构。

北京司法鉴定平台业务

鉴定领域:司法亲子鉴定、个人亲子鉴定、移民亲子鉴定、落户亲子鉴定、胎儿亲子鉴定、亲缘关系鉴定、DNA身份识别、线粒体DNA检测、基因身份证、DNA寻亲觅祖及种属鉴定等鉴定项目。

北京科研技术平台

北京科研技术平台是国内早期一批从事DNA检测研究的平台。其STR分型检测技术较早应用亲子鉴定和细胞鉴定,领衔建设协助国内多家DNA实验建设和人员培训,向行业输送大量的DNA检测研发工作者。同时开发了基因检测行业新的多种产品,为STR分型检测行业贡献力量。在亲子鉴定和细胞鉴定上有着延续十多年的经验,同时产前无创亲子鉴定技术,有着较高的质量控制标准。

北京科研技术平台业务

鉴定领域:个人亲子鉴定、产前无创亲子鉴定、个体识别、人源细胞STR鉴定、小鼠细胞STR鉴定、种属鉴定、猴源细胞鉴定、仓鼠细胞鉴定、大鼠细胞鉴定、HLA分型、支原体检测(PCR法+恒温法)、核型分析(NGS技术)、精斑血斑确认。

中心点评(11)

4.8

专业水平:4.9分服务水平:4.9分位置环境:4.8分

全部(20) 交通便利(6) 服务热情(5) 法医专业(5) 解读清晰(3) 还会再来(1)

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